常在性接触后3周--8个月发病（潜伏期长），病变位于阴茎头、冠状沟、包皮系带、尿道口等处，呈柔软乳头状肉疙瘩，呈灰白、淡黄或粉红色，触之易出血。可以是单个，也可以密集成簇，有点像菜花样。

包皮龟头炎表现为包皮红肿、灼痛、排尿时加重、可有脓性分泌物自包皮口流出。如将包皮翻转，可见包皮内板和阴茎头充血、肿胀、重者可有浅小溃疡或糜烂，表现有脓液。临床表现还可能为局部水肿性红斑、糜烂、渗液和出血，严重者可出现水疱。

男性生殖器疱疹症状主要表现在龟头、冠状沟、尿道口、阴茎、阴囊、大腿和臂部等处。大多数男病人双侧腹股沟淋巴结肿大。后期炎症波及尿道、膀胱时，可出现排尿困难、尿痛、尿频、严重者可发生尿潴留等现象。